يعتبر قسم المشاريع الإنشائية من الأقسام الفاعلة بالمؤسسة كونة يهتم بالجانب الإنشائي والبناء فهو يقوم بإعداد الدراسات والتصاميم للمشاريع التي يتم تنفيذها عبر المؤسسة والتي تسهم في تقديم الخدمات العامة للمواطنين دون استثناء على سبيل المثال لا الحصر مثل بناء وترميم المساجد وحفر آبارمياة الشرب الإرتوازية وتسوير المقابر وترميم المدارس . وقد قام القسم بتنفيذ بعض المشاريع منها :